Linux下的转换方法:formchkH2O,chk,即可生成H2O,fchk文件,Windows下可直接使用Gaussian软件自带的Utilities-FormChk模块进行转化,生成对应的,fch文件,输出文件,out的查看,打开H2O,out文件后托至文档末尾,可以看到一句名人名言以及计算耗时等信息,表明计算任务顺利结束,若任务失败,则会提示任务失败并中断,此时需根据报错信息来排查可能的问题并修改输入文件。
无论是DFT还是HF方法的模拟,均需选择合适的基组,此处给出的是较为通用且精度尚可的基组,【前缀】【主词】【后缀】关于基组的选用,可参考sob老师的文章“http://sobereva,com/336”,“opt”指本次模拟的具体任务为结构优化,这些命令可根据情况连用,例如“optfreq”表示首先进行结构优化,随后对优化的结构进行振动分析,该值根据实际计算情况修改即可,例如计算一个Cu2+时为2,计算苯分子时为0,计算一个SO42-时为-2。
输入文件:文件后缀名通常为,gjf,包含模拟任务的计算资源分配(核数、内存使用情况)、计算方法和精度、任务要求及计算模型等信息,输出文件:文件后缀名通常为,out或,log,除输出作为计算结果的结构模型、轨道、密度矩阵、电荷布局等信息外,还包括了部分计算过程中输出信息,对于大多数含有过渡金属的结构、自由基结构、激发态,如二茂铁、基态氧分子、羟基自由基等,均为开壳层体系,自旋多重度大于1,需做进一步判断。