成都世纪美扬科技有限公司

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上海分辨率模拟计算检测
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产品: 浏览次数:38上海分辨率模拟计算检测 
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最后更新: 2022-09-28 11:42
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ubi20z

*补充说明:输入文件,gjf内容的zui末尾务必保证存在空行,否则在计算过程中会报错,在Linux服务器中进行模拟,通过SSH远程连接服务器(图中使用Xshell和Xftp软件),Xftp用于在本地电脑和服务器间传输文件,在服务器端选择合适的路径建立文件夹并重命名为“H2O_opt”后进入该文件夹,将本地电脑端的H2O,随后“ctrl+c”切出,并用“exit”命令即可关闭SSH远程连接而不导致计算任务中断。

无论是DFT还是HF方法的模拟,均需选择合适的基组,此处给出的是较为通用且精度尚可的基组,【前缀】【主词】【后缀】关于基组的选用,可参考sob老师的文章“http://sobereva,com/336”,“opt”指本次模拟的具体任务为结构优化,这些命令可根据情况连用,例如“optfreq”表示首先进行结构优化,随后对优化的结构进行振动分析,该值根据实际计算情况修改即可,例如计算一个Cu2+时为2,计算苯分子时为0,计算一个SO42-时为-2。

输入文件:文件后缀名通常为,gjf,包含模拟任务的计算资源分配(核数、内存使用情况)、计算方法和精度、任务要求及计算模型等信息,输出文件:文件后缀名通常为,out或,log,除输出作为计算结果的结构模型、轨道、密度矩阵、电荷布局等信息外,还包括了部分计算过程中输出信息,对于大多数含有过渡金属的结构、自由基结构、激发态,如二茂铁、基态氧分子、羟基自由基等,均为开壳层体系,自旋多重度大于1,需做进一步判断。