Linux下的转换方法:formchkH2O,chk,即可生成H2O,fchk文件,Windows下可直接使用Gaussian软件自带的Utilities-FormChk模块进行转化,生成对应的,fch文件,输出文件,out的查看,打开H2O,out文件后托至文档末尾,可以看到一句名人名言以及计算耗时等信息,表明计算任务顺利结束,若任务失败,则会提示任务失败并中断,此时需根据报错信息来排查可能的问题并修改输入文件。
任务的计算方法和内容部分,“#”指以正常形式输出计算结果,若希望以更为详细的形式输出结果,可写作“#P”,若希望以精简形式输出,可写作“#T”,“b3lyp”决定本次模拟采用DFT方法并选用b3lyp泛函进行计算,泛函应根据实际需要进行选择,此处给出的较为通用且精度尚可的杂化泛函,例如Summary中包含了当前帧的基本信息(电子自旋、能量等),Optimization可显示优化过程中体系的能量和平均受力(RMS)变化情况。
输入文件:文件后缀名通常为,gjf,包含模拟任务的计算资源分配(核数、内存使用情况)、计算方法和精度、任务要求及计算模型等信息,输出文件:文件后缀名通常为,out或,log,除输出作为计算结果的结构模型、轨道、密度矩阵、电荷布局等信息外,还包括了部分计算过程中输出信息,对于大多数含有过渡金属的结构、自由基结构、激发态,如二茂铁、基态氧分子、羟基自由基等,均为开壳层体系,自旋多重度大于1,需做进一步判断。