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在透射电镜中，用电子束代替平行入射光束，用薄膜状的样品代替周期性结构物体，就可重复以上衍射成像过程，（2）对于透射电镜，改变中间镜的电流，使中间镜的物平面从一次像平面移向物镜的后焦面，可得到衍射谱，固定的目的主要是终止组织细胞的生化过程，同时把它们的超微结构改变控制在zui小范围内，并保护这些结构在后续的脱水、包埋等过程中不被破坏；常用双固定法，用一定浓度的戊二醛对样品预固定，漂洗后使用锇酸对样品进行后固定。
沿管壁缓慢加入戊二醛预固定液，不要冲击细胞团，静置30min后可送样，请在4~10℃保存或运输，严禁结冰（太靠近冰箱后壁或冰袋运输都可能使样品结冰，冬季宁可常温送样），细胞高速离心收集方法，本方法过去被大多数单位采用，没有“GT2”时的应急取材也可使用，各仪器公司的拍摄控制软件是比较专业化的处理工具，能够在处理基本粒径分析、晶面间距等测量外，还能够进行傅里叶变换、降噪处理等，得到更加深入的数据结果。
染色方法有单染，包括铅盐单染和铀盐单染；双染色，醋酸铀染色和柠檬酸铅染色，双染色呈现结果更全面，我们一般采用的双染法进行染色，常用染色剂：醋酸铀，有微弱的放射性，主要染核酸、核蛋白、细胞核、结缔组织，柠檬酸铅，主要染膜结构、脂类、糖原等，易与CO2反应成沉淀，染色中应采取措施避免，电镜照片主要解析粒径分布、单晶/多晶、晶面结构、元素和原子分散，其本质是信号的空间分布，基本机理与比例尺地图是一致的。