若该值设定不合理,则计算出来的结构并非基态,这一部分内容会在后文中详细介绍,此处仅给出一个简单的判断标准,对于大多数不包含过渡金属的基态分子,例如水、苯、SO42-、常规有机体系等均为闭壳层体系,其自旋多重度为1,模型,该体系中包含的1个O原子和2个H原子,以及这三个原子各自的笛卡尔坐标,对比修改前后的输入文件,可以看到我们删除了第2行中“geom=connectivity”字样和11-13行的内容。
原子间的连接方式,这些字样代表原子之间的连接关系,对于量化模拟毫无意义,故而可直接删掉,这是由于量化模拟会在计算过程中根据原子各自电子云间的交叠情况自主判断成键形式,因此软件并不关心输入模型中的化学键,换言之,在建模时,水分子中O和H之间画成单键抑或三键,对于计算结果没有任何影响,那么此时,Results栏中的“Vibrations”可选,从中可以分析分子的所有振动形式及对应的红外光谱出峰位置,进而生成该分子的理论红外光谱。
输入文件:文件后缀名通常为,gjf,包含模拟任务的计算资源分配(核数、内存使用情况)、计算方法和精度、任务要求及计算模型等信息,输出文件:文件后缀名通常为,out或,log,除输出作为计算结果的结构模型、轨道、密度矩阵、电荷布局等信息外,还包括了部分计算过程中输出信息,对于大多数含有过渡金属的结构、自由基结构、激发态,如二茂铁、基态氧分子、羟基自由基等,均为开壳层体系,自旋多重度大于1,需做进一步判断。